平成31年3月29日（東京都規則第32号、東京都組織規程の一部を改正する規則）
政策企画局総務部「管理課」の次に「渉外課」を加える。
同局調整部を次のように改める。
総務局行政改革推進部「監理団体指導課」を「グループ経営戦略課」に改める。
同局情報通信企画部を廃止する。
都市整備局総務部を次のように改める。
同局市街地整備部「多摩ニュータウン事業室」を「多摩ニュータウン課」に改める。
同局住宅政策推進部及び都営住宅経営部を廃止する。
平成31年3月29日（東京都訓令第40号、東京都青少年・治安対策本部処務規程）
青少年・治安対策本部を「都民安全推進本部」に改め、その分課を次のように定める。
- 「総合推進部
- 総務課、都民安全推進課、治安対策課、交通安全課、若年支援課」
平成31年3月29日（東京都訓令第41号、東京都戦略政策情報推進本部処務規程）
戦略政策情報推進本部処務規程を次のように定める。
- 「戦略事業部
- 総務課、特区・戦略事業推進課
- ＩＣＴ推進部
- 企画課、情報通信運用課」
平成31年3月29日（東京都訓令第42号、東京都住宅政策本部処務規程）
住宅政策本部処務規程を次のように定める。
- 「住宅企画部
- 総務課、企画経理課、民間住宅課、マンション課、不動産業課
- 都営住宅経営部
- 経営企画課、指導管理課、資産活用課、住宅整備課、施設整備課、技術管理課」
（4月1日から施行）
政策企画局
- 総務部
- 総務課、秘書課、管理課、渉外課（H31.4.1）
- 政策調整部（H31.4.1）
- 政策調整課（H31.4.1）、報道課（H31.4.1）
- 計画部
- 計画課
- 外務部
- 管理課、企画課、事業課
都民安全推進本部（H31.4.1）
- 総合推進部（H31.4.1）
- 総務課（H31.4.1）、都民安全推進課（H31.4.1）、治安対策課（H31.4.1）、交通安全課（H31.4.1）、若年支援課（H31.4.1）
戦略政策情報推進本部（H31.4.1）
- 戦略事業部（H31.4.1）
- 総務課（H31.4.1）、特区・戦略事業推進課（H31.4.1）
- ＩＣＴ推進部（H31.4.1）
- 企画課（H31.4.1）、情報通信運用課（H31.4.1）
総務局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、文書課、法務課
- 復興支援対策部
- 被災地支援課、都内避難者支援課
- 行政改革推進部
- 行政改革課、グループ経営戦略課（H31.4.1）
- 人事部
- 人事課、職員支援課、制度企画課、調査課
- コンプライアンス推進部
- コンプライアンス推進課
- 行政部
- 振興企画課、区政課、市町村課
- 総合防災部
- 防災管理課、防災計画課、防災対策課、防災通信課
- 統計部
- 調整課、人口統計課、産業統計課、社会統計課
- 人権部
- 企画課、人権施策推進課
財務局
- 経理部
- 総務課、契約第一課、契約第二課、検収課
- 主計部
- 議案課、財政課、予算第一課、予算第二課、予算第三課、公債課
- 財産運用部
- 管理課、総合調整課、活用促進課
- 建築保全部
- 工務課、技術管理課、庁舎管理課、庁舎整備課、施設整備第一課、施設整備第二課、オリンピック・パラリンピック施設整備課
主税局
- 総務部
- 総務課、職員課、経理課
- 税制部
- 税制課、税制調査課、歳入課、システム管理課、評価審査課
- 課税部
- 計画課、課税指導課、法人課税指導課、査察課
- 資産税部
- 計画課、固定資産税課、固定資産評価課
- 徴収部
- 計画課、徴収指導課、納税推進課、個人都民税対策課、機動整理課
生活文化局
- 総務部
- 総務課、企画計理課
- 広報広聴部
- 広報課、情報公開課、都民の声課
- 都民生活部
- 管理法人課、地域活動推進課、男女平等参画課、旅券課
- 消費生活部
- 企画調整課、取引指導課、生活安全課
- 私学部
- 私学振興課、私学行政課
- 文化振興部
- 企画調整課、文化事業課
オリンピック・パラリンピック準備局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、企画調整課
- 計画推進部
- 調整課、運営課、競技・渉外課、事業推進課
- パラリンピック部
- 調整課、障害者スポーツ課
- 大会施設部
- 調整課、施設整備第一課、施設整備第二課、輸送課
- スポーツ推進部
- 調整課、ラグビーワールドカップ開催準備課、事業推進課
都市整備局
- 総務部
- 総務課、経理課（H31.4.1）、企画技術課（H31.4.1）
- 都市づくり政策部
- 広域調整課、都市計画課、土地利用計画課、開発企画課、緑地景観課
- 都市基盤部
- 調整課、交通企画課、街路計画課
- 市街地整備部
- 管理課、企画課、防災都市づくり課、区画整理課、再開発課、多摩ニュータウン課（H31.4.1）
- 市街地建築部
- 調整課、建築企画課、建築指導課、建設業課
- 基地対策部
-
住宅政策本部（H31.4.1）
- 住宅企画部（H31.4.1）
- 総務課（H31.4.1）、企画経理課（H31.4.1）、民間住宅課（H31.4.1）、マンション課（H31.4.1）、不動産業課（H31.4.1）
- 都営住宅経営部（H31.4.1）
- 経営企画課（H31.4.1）、指導管理課（H31.4.1）、資産活用課（H31.4.1）、住宅整備課（H31.4.1）、施設整備課（H31.4.1）、技術管理課（H31.4.1）
環境局
- 総務部
- 総務課、環境政策課、経理課
- 地球環境エネルギー部
- 計画課、総量削減課、地域エネルギー課、環境都市づくり課、次世代エネルギー推進課
- 環境改善部
- 計画課、大気保全課、化学物質対策課、環境保安課、自動車環境課
- 自然環境部
- 計画課、緑環境課、水環境課
- 資源循環推進部
- 計画課、一般廃棄物対策課、産業廃棄物対策課
福祉保健局
- 総務部
- 総務課、企画政策課、計理課、契約管財課、職員課
- 指導監査部
- 指導調整課、指導第一課、指導第二課、指導第三課
- 医療政策部
- 医療政策課、救急災害医療課、医療安全課、医療人材課
- 保健政策部
- 保健政策課、健康推進課、疾病対策課、医療助成課、国民健康保険課
- 生活福祉部
- 計画課、保護課、地域福祉課
- 高齢社会対策部
- 計画課、介護保険課、在宅支援課、施設支援課
- 少子社会対策部
- 計画課、家庭支援課、育成支援課、保育支援課
- 障害者施策推進部
- 計画課、地域生活支援課、施設サービス支援課、精神保健医療課
- 健康安全部
- 健康安全課、食品監視課、薬務課、環境保健衛生課、感染症対策課
病院経営本部
- 経営企画部
- 総務課、財務課、職員課
- サービス推進部
- 事業支援課
産業労働局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、職員課
- 商工部
- 調整課、創業支援課、経営支援課、地域産業振興課
- 金融部
- 金融課、貸金業対策課
- 観光部
- 企画課、振興課、受入環境課
- 農林水産部
- 調整課、食料安全課、農業振興課、水産課、森林課
- 雇用就業部
- 調整課、就業推進課、労働環境課、能力開発課
中央卸売市場
- 管理部
- 総務課、市場政策課、財務課
- 事業部
- 業務課、施設課
建設局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、技術管理課、職員課、用度課
- 用地部
- 管理課、用地課、調整課
- 道路管理部
- 管理課、路政課、監察指導課、保全課、安全施設課
- 道路建設部
- 管理課、計画課、鉄道関連事業課、街路課、道路橋梁課
- 三環状道路整備推進部
- 管理課、整備推進課
- 公園緑地部
- 管理課、計画課、公園課、公園建設課
- 河川部
- 管理課、指導調整課、計画課、改修課、防災課
港湾局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、財務課
- 港湾経営部
- 経営課、振興課
- 臨海開発部
- 開発企画課、誘致促進課、開発整備課、海上公園課
- 港湾整備部
- 建設調整課、計画課、技術管理課、施設建設課
- 離島港湾部
- 管理課、計画課、建設課
会計管理局
- 管理部
- 総務課、公金管理課、会計企画課、出納課
- 警察・消防出納部
- 警察出納課、消防出納課
令和元年8月1日現在
平成31年4月1日と同じ
令和元年11月29日（東京都規則第100号、東京都組織規程の一部を改正する規則）
オリンピック・パラリンピック準備局スポーツ推進部の「ラグビーワールドカップ開催準備課」を廃止する。
（12月1日から施行）
令和2年3月31日（東京都訓令第7号、東京都戦略政策情報推進本部処務規程）
戦略政策情報推進本部ＩＣＴ推進部を次のように改める。
- 「ＩＣＴ推進部
- 企画課、ＩＣＴ戦略推進課、次世代通信推進課、情報通信運用課」
（4月1日から施行）
政策企画局
- 総務部
- 総務課、秘書課、管理課、渉外課
- 政策調整部
- 政策調整課、報道課
- 計画部
- 計画課
- 外務部
- 管理課、企画課、事業課
都民安全推進本部
- 総合推進部
- 総務課、都民安全推進課、治安対策課、交通安全課、若年支援課
戦略政策情報推進本部
- 戦略事業部
- 総務課、特区・戦略事業推進課
- ＩＣＴ推進部
- 企画課、ＩＣＴ戦略推進課（R2.4.1）、次世代通信推進課（R2.4.1）、情報通信運用課
総務局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、文書課、法務課
- 復興支援対策部
- 被災地支援課、都内避難者支援課
- 行政改革推進部
- 行政改革課、グループ経営戦略課
- 人事部
- 人事課、職員支援課、制度企画課、調査課
- コンプライアンス推進部
- コンプライアンス推進課
- 行政部
- 振興企画課、区政課、市町村課
- 総合防災部
- 防災管理課、防災計画課、防災対策課、防災通信課
- 統計部
- 調整課、人口統計課、産業統計課、社会統計課
- 人権部
- 企画課、人権施策推進課
財務局
- 経理部
- 総務課、契約第一課、契約第二課、検収課
- 主計部
- 議案課、財政課、予算第一課、予算第二課、予算第三課、公債課
- 財産運用部
- 管理課、総合調整課、活用促進課
- 建築保全部
- 工務課、技術管理課、庁舎管理課、庁舎整備課、施設整備第一課、施設整備第二課、オリンピック・パラリンピック施設整備課
主税局
- 総務部
- 総務課、職員課、経理課
- 税制部
- 税制課、税制調査課、歳入課、システム管理課、評価審査課
- 課税部
- 計画課、課税指導課、法人課税指導課、査察課
- 資産税部
- 計画課、固定資産税課、固定資産評価課
- 徴収部
- 計画課、徴収指導課、納税推進課、個人都民税対策課、機動整理課
生活文化局
- 総務部
- 総務課、企画計理課
- 広報広聴部
- 広報課、情報公開課、都民の声課
- 都民生活部
- 管理法人課、地域活動推進課、男女平等参画課、旅券課
- 消費生活部
- 企画調整課、取引指導課、生活安全課
- 私学部
- 私学振興課、私学行政課
- 文化振興部
- 企画調整課、文化事業課
オリンピック・パラリンピック準備局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、企画調整課
- 計画推進部
- 調整課、運営課、競技・渉外課、事業推進課
- パラリンピック部
- 調整課、障害者スポーツ課
- 大会施設部
- 調整課、施設整備第一課、施設整備第二課、輸送課
- スポーツ推進部
- 調整課、事業推進課
都市整備局
- 総務部
- 総務課、経理課、企画技術課
- 都市づくり政策部
- 広域調整課、都市計画課、土地利用計画課、開発企画課、緑地景観課
- 都市基盤部
- 調整課、交通企画課、街路計画課
- 市街地整備部
- 管理課、企画課、防災都市づくり課、区画整理課、再開発課、多摩ニュータウン課
- 市街地建築部
- 調整課、建築企画課、建築指導課、建設業課
- 基地対策部
-
住宅政策本部
- 住宅企画部
- 総務課、企画経理課、民間住宅課、マンション課、不動産業課
- 都営住宅経営部
- 経営企画課、指導管理課、資産活用課、住宅整備課、施設整備課、技術管理課
環境局
- 総務部
- 総務課、環境政策課、経理課
- 地球環境エネルギー部
- 計画課、総量削減課、地域エネルギー課、環境都市づくり課、次世代エネルギー推進課
- 環境改善部
- 計画課、大気保全課、化学物質対策課、環境保安課、自動車環境課
- 自然環境部
- 計画課、緑環境課、水環境課
- 資源循環推進部
- 計画課、一般廃棄物対策課、産業廃棄物対策課
福祉保健局
- 総務部
- 総務課、企画政策課、計理課、契約管財課、職員課
- 指導監査部
- 指導調整課、指導第一課、指導第二課、指導第三課
- 医療政策部
- 医療政策課、救急災害医療課、医療安全課、医療人材課
- 保健政策部
- 保健政策課、健康推進課、疾病対策課、医療助成課、国民健康保険課
- 生活福祉部
- 計画課、保護課、地域福祉課
- 高齢社会対策部
- 計画課、介護保険課、在宅支援課、施設支援課
- 少子社会対策部
- 計画課、家庭支援課、育成支援課、保育支援課
- 障害者施策推進部
- 計画課、地域生活支援課、施設サービス支援課、精神保健医療課
- 健康安全部
- 健康安全課、食品監視課、薬務課、環境保健衛生課、感染症対策課
病院経営本部
- 経営企画部
- 総務課、財務課、職員課
- サービス推進部
- 事業支援課
産業労働局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、職員課
- 商工部
- 調整課、創業支援課、経営支援課、地域産業振興課
- 金融部
- 金融課、貸金業対策課
- 観光部
- 企画課、振興課、受入環境課
- 農林水産部
- 調整課、食料安全課、農業振興課、水産課、森林課
- 雇用就業部
- 調整課、就業推進課、労働環境課、能力開発課
中央卸売市場
- 管理部
- 総務課、市場政策課、財務課
- 事業部
- 業務課、施設課
建設局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、技術管理課、職員課、用度課
- 用地部
- 管理課、用地課、調整課
- 道路管理部
- 管理課、路政課、監察指導課、保全課、安全施設課
- 道路建設部
- 管理課、計画課、鉄道関連事業課、街路課、道路橋梁課
- 三環状道路整備推進部
- 管理課、整備推進課
- 公園緑地部
- 管理課、計画課、公園課、公園建設課
- 河川部
- 管理課、指導調整課、計画課、改修課、防災課
港湾局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、財務課
- 港湾経営部
- 経営課、振興課
- 臨海開発部
- 開発企画課、誘致促進課、開発整備課、海上公園課
- 港湾整備部
- 建設調整課、計画課、技術管理課、施設建設課
- 離島港湾部
- 管理課、計画課、建設課
会計管理局
- 管理部
- 総務課、公金管理課、会計企画課、出納課
- 警察・消防出納部
- 警察出納課、消防出納課
令和2年7月10日（東京都規則第125号、東京都組織規程の一部を改正する規則）
福祉保健局健康安全部「感染症対策課」を廃止する。
同局健康安全部の次に「感染症対策部」を加え、その分課を次のように定める。
- 「感染症対策部
- 計画課、防疫・情報管理課、事業推進課」
（7月13日から施行）
政策企画局
- 総務部
- 総務課、秘書課、管理課、渉外課
- 政策調整部
- 政策調整課、報道課
- 計画部
- 計画課
- 外務部
- 管理課、企画課、事業課
都民安全推進本部
- 総合推進部
- 総務課、都民安全推進課、治安対策課、交通安全課、若年支援課
戦略政策情報推進本部
- 戦略事業部
- 総務課、特区・戦略事業推進課
- ＩＣＴ推進部
- 企画課、ＩＣＴ戦略推進課、次世代通信推進課、情報通信運用課
総務局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、文書課、法務課
- 復興支援対策部
- 被災地支援課、都内避難者支援課
- 行政改革推進部
- 行政改革課、グループ経営戦略課
- 人事部
- 人事課、職員支援課、制度企画課、調査課
- コンプライアンス推進部
- コンプライアンス推進課
- 行政部
- 振興企画課、区政課、市町村課
- 総合防災部
- 防災管理課、防災計画課、防災対策課、防災通信課
- 統計部
- 調整課、人口統計課、産業統計課、社会統計課
- 人権部
- 企画課、人権施策推進課
財務局
- 経理部
- 総務課、契約第一課、契約第二課、検収課
- 主計部
- 議案課、財政課、予算第一課、予算第二課、予算第三課、公債課
- 財産運用部
- 管理課、総合調整課、活用促進課
- 建築保全部
- 工務課、技術管理課、庁舎管理課、庁舎整備課、施設整備第一課、施設整備第二課、オリンピック・パラリンピック施設整備課
主税局
- 総務部
- 総務課、職員課、経理課
- 税制部
- 税制課、税制調査課、歳入課、システム管理課、評価審査課
- 課税部
- 計画課、課税指導課、法人課税指導課、査察課
- 資産税部
- 計画課、固定資産税課、固定資産評価課
- 徴収部
- 計画課、徴収指導課、納税推進課、個人都民税対策課、機動整理課
生活文化局
- 総務部
- 総務課、企画計理課
- 広報広聴部
- 広報課、情報公開課、都民の声課
- 都民生活部
- 管理法人課、地域活動推進課、男女平等参画課、旅券課
- 消費生活部
- 企画調整課、取引指導課、生活安全課
- 私学部
- 私学振興課、私学行政課
- 文化振興部
- 企画調整課、文化事業課
オリンピック・パラリンピック準備局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、企画調整課
- 計画推進部
- 調整課、運営課、競技・渉外課、事業推進課
- パラリンピック部
- 調整課、障害者スポーツ課
- 大会施設部
- 調整課、施設整備第一課、施設整備第二課、輸送課
- スポーツ推進部
- 調整課、事業推進課
都市整備局
- 総務部
- 総務課、経理課、企画技術課
- 都市づくり政策部
- 広域調整課、都市計画課、土地利用計画課、開発企画課、緑地景観課
- 都市基盤部
- 調整課、交通企画課、街路計画課
- 市街地整備部
- 管理課、企画課、防災都市づくり課、区画整理課、再開発課、多摩ニュータウン課
- 市街地建築部
- 調整課、建築企画課、建築指導課、建設業課
- 基地対策部
-
住宅政策本部
- 住宅企画部
- 総務課、企画経理課、民間住宅課、マンション課、不動産業課
- 都営住宅経営部
- 経営企画課、指導管理課、資産活用課、住宅整備課、施設整備課、技術管理課
環境局
- 総務部
- 総務課、環境政策課、経理課
- 地球環境エネルギー部
- 計画課、総量削減課、地域エネルギー課、環境都市づくり課、次世代エネルギー推進課
- 環境改善部
- 計画課、大気保全課、化学物質対策課、環境保安課、自動車環境課
- 自然環境部
- 計画課、緑環境課、水環境課
- 資源循環推進部
- 計画課、一般廃棄物対策課、産業廃棄物対策課
福祉保健局
- 総務部
- 総務課、企画政策課、計理課、契約管財課、職員課
- 指導監査部
- 指導調整課、指導第一課、指導第二課、指導第三課
- 医療政策部
- 医療政策課、救急災害医療課、医療安全課、医療人材課
- 保健政策部
- 保健政策課、健康推進課、疾病対策課、医療助成課、国民健康保険課
- 生活福祉部
- 計画課、保護課、地域福祉課
- 高齢社会対策部
- 計画課、介護保険課、在宅支援課、施設支援課
- 少子社会対策部
- 計画課、家庭支援課、育成支援課、保育支援課
- 障害者施策推進部
- 計画課、地域生活支援課、施設サービス支援課、精神保健医療課
- 健康安全部
- 健康安全課、食品監視課、薬務課、環境保健衛生課
- 感染症対策部（R2.7.13）
- 計画課（R2.7.13）、防疫・情報管理課（R3.7.13）、事業推進課（R3.7.13）
病院経営本部
- 経営企画部
- 総務課、財務課、職員課
- サービス推進部
- 事業支援課
産業労働局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、職員課
- 商工部
- 調整課、創業支援課、経営支援課、地域産業振興課
- 金融部
- 金融課、貸金業対策課
- 観光部
- 企画課、振興課、受入環境課
- 農林水産部
- 調整課、食料安全課、農業振興課、水産課、森林課
- 雇用就業部
- 調整課、就業推進課、労働環境課、能力開発課
中央卸売市場
- 管理部
- 総務課、市場政策課、財務課
- 事業部
- 業務課、施設課
建設局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、技術管理課、職員課、用度課
- 用地部
- 管理課、用地課、調整課
- 道路管理部
- 管理課、路政課、監察指導課、保全課、安全施設課
- 道路建設部
- 管理課、計画課、鉄道関連事業課、街路課、道路橋梁課
- 三環状道路整備推進部
- 管理課、整備推進課
- 公園緑地部
- 管理課、計画課、公園課、公園建設課
- 河川部
- 管理課、指導調整課、計画課、改修課、防災課
港湾局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、財務課
- 港湾経営部
- 経営課、振興課
- 臨海開発部
- 開発企画課、誘致促進課、開発整備課、海上公園課
- 港湾整備部
- 建設調整課、計画課、技術管理課、施設建設課
- 離島港湾部
- 管理課、計画課、建設課
会計管理局
- 管理部
- 総務課、公金管理課、会計企画課、出納課
- 警察・消防出納部
- 警察出納課、消防出納課
令和3年3月31日（東京都条例第4号、東京都組織条例程の一部を改正する条例）
財務局の次に「デジタルサービス局」を加える。
令和3年3月31日（東京都規則第98号、東京都組織規程の一部を改正する規則）
政策企画局外務部の次に「戦略事業部」を加え、その分課を次のように定める。
総務局総務部の「法務課」の次に「グループ経営戦略課」を加える。
同局「行政改革推進部」を廃止する。
財務局の次に「デジタルサービス局」を加え、その分課を次のように定める。
- 「総務部
- 総務課、企画計理課
- 戦略部
- 戦略課、デジタル推進課、デジタル改革課
- デジタルサービス推進部
- デジタルサービス推進課、ネットワーク推進課
- デジタル基盤整備部
- 情報システム企画課、情報システム運用課」
産業労働局総務部の「企画計理課」を「企画調整課、計理課」に改める。
（4月1日から施行）
令和3年3月31日（東京都訓令第4号、東京都戦略政策情報推進本部処務規程）
東京都戦略政策情報推進本部処務規定を廃止する。
（4月1日から施行）
政策企画局
- 総務部
- 総務課、秘書課、管理課、渉外課
- 政策調整部
- 政策調整課、報道課
- 計画部
- 計画課
- 外務部
- 管理課、企画課、事業課
- 戦略事業部（R3.4.1）
- 戦略事業課（R3.4.1）
都民安全推進本部
- 総合推進部
- 総務課、都民安全推進課、治安対策課、交通安全課、若年支援課
総務局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、文書課、法務課、グループ経営戦略課（R3.4.1）
- 復興支援対策部
- 被災地支援課、都内避難者支援課
- 人事部
- 人事課、職員支援課、制度企画課、調査課
- コンプライアンス推進部
- コンプライアンス推進課
- 行政部
- 振興企画課、区政課、市町村課
- 総合防災部
- 防災管理課、防災計画課、防災対策課、防災通信課
- 統計部
- 調整課、人口統計課、産業統計課、社会統計課
- 人権部
- 企画課、人権施策推進課
財務局
- 経理部
- 総務課、契約第一課、契約第二課、検収課
- 主計部
- 議案課、財政課、予算第一課、予算第二課、予算第三課、公債課
- 財産運用部
- 管理課、総合調整課、活用促進課
- 建築保全部
- 工務課、技術管理課、庁舎管理課、庁舎整備課、施設整備第一課、施設整備第二課、オリンピック・パラリンピック施設整備課
デジタルサービス局(R3.4.1）
- 総務部（R3.4.1）
- 総務課（R3.4.1）、企画計理課（R3.4.1）
- 戦略部（R3.4.1）
- 戦略課（R3.4.1）、デジタル推進課（R3.4.1）、デジタル改革課（R3.4.1）
- デジタルサービス推進部（R3.4.1）
- デジタルサービス推進課（R3.4.1）、ネットワーク推進課（R3.4.1）
- デジタル基盤整備部（R3.4.1）
- 情報システム企画課（R3.4.1）、情報システム運用課（R3.4.1）
主税局
- 総務部
- 総務課、職員課、経理課
- 税制部
- 税制課、税制調査課、歳入課、システム管理課、評価審査課
- 課税部
- 計画課、課税指導課、法人課税指導課、査察課
- 資産税部
- 計画課、固定資産税課、固定資産評価課
- 徴収部
- 計画課、徴収指導課、納税推進課、個人都民税対策課、機動整理課
生活文化局
- 総務部
- 総務課、企画計理課
- 広報広聴部
- 広報課、情報公開課、都民の声課
- 都民生活部
- 管理法人課、地域活動推進課、男女平等参画課、旅券課
- 消費生活部
- 企画調整課、取引指導課、生活安全課
- 私学部
- 私学振興課、私学行政課
- 文化振興部
- 企画調整課、文化事業課
オリンピック・パラリンピック準備局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、企画調整課
- 計画推進部
- 調整課、運営課、競技・渉外課、事業推進課
- パラリンピック部
- 調整課、障害者スポーツ課
- 大会施設部
- 調整課、施設整備第一課、施設整備第二課、輸送課
- スポーツ推進部
- 調整課、事業推進課
都市整備局
- 総務部
- 総務課、経理課、企画技術課
- 都市づくり政策部
- 広域調整課、都市計画課、土地利用計画課、開発企画課、緑地景観課
- 都市基盤部
- 調整課、交通企画課、街路計画課
- 市街地整備部
- 管理課、企画課、防災都市づくり課、区画整理課、再開発課、多摩ニュータウン課
- 市街地建築部
- 調整課、建築企画課、建築指導課、建設業課
- 基地対策部
-
住宅政策本部
- 住宅企画部
- 総務課、企画経理課、民間住宅課、マンション課、不動産業課
- 都営住宅経営部
- 経営企画課、指導管理課、資産活用課、住宅整備課、施設整備課、技術管理課
環境局
- 総務部
- 総務課、環境政策課、経理課
- 地球環境エネルギー部
- 計画課、総量削減課、地域エネルギー課、環境都市づくり課、次世代エネルギー推進課
- 環境改善部
- 計画課、大気保全課、化学物質対策課、環境保安課、自動車環境課
- 自然環境部
- 計画課、緑環境課、水環境課
- 資源循環推進部
- 計画課、一般廃棄物対策課、産業廃棄物対策課
福祉保健局
- 総務部
- 総務課、企画政策課、計理課、契約管財課、職員課
- 指導監査部
- 指導調整課、指導第一課、指導第二課、指導第三課
- 医療政策部
- 医療政策課、救急災害医療課、医療安全課、医療人材課
- 保健政策部
- 保健政策課、健康推進課、疾病対策課、医療助成課、国民健康保険課
- 生活福祉部
- 計画課、保護課、地域福祉課
- 高齢社会対策部
- 計画課、介護保険課、在宅支援課、施設支援課
- 少子社会対策部
- 計画課、家庭支援課、育成支援課、保育支援課
- 障害者施策推進部
- 計画課、地域生活支援課、施設サービス支援課、精神保健医療課
- 健康安全部
- 健康安全課、食品監視課、薬務課、環境保健衛生課
- 感染症対策部
- 計画課、防疫・情報管理課、事業推進課
病院経営本部
- 経営企画部
- 総務課、財務課、職員課
- サービス推進部
- 事業支援課
産業労働局
- 総務部
- 総務課、企画調整課（R3.4.1）、計理課（R3.4.1）、職員課
- 商工部
- 調整課、創業支援課、経営支援課、地域産業振興課
- 金融部
- 金融課、貸金業対策課
- 観光部
- 企画課、振興課、受入環境課
- 農林水産部
- 調整課、食料安全課、農業振興課、水産課、森林課
- 雇用就業部
- 調整課、就業推進課、労働環境課、能力開発課
中央卸売市場
- 管理部
- 総務課、市場政策課、財務課
- 事業部
- 業務課、施設課
建設局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、技術管理課、職員課、用度課
- 用地部
- 管理課、用地課、調整課
- 道路管理部
- 管理課、路政課、監察指導課、保全課、安全施設課
- 道路建設部
- 管理課、計画課、鉄道関連事業課、街路課、道路橋梁課
- 三環状道路整備推進部
- 管理課、整備推進課
- 公園緑地部
- 管理課、計画課、公園課、公園建設課
- 河川部
- 管理課、指導調整課、計画課、改修課、防災課
港湾局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、財務課
- 港湾経営部
- 経営課、振興課
- 臨海開発部
- 開発企画課、誘致促進課、開発整備課、海上公園課
- 港湾整備部
- 建設調整課、計画課、技術管理課、施設建設課
- 離島港湾部
- 管理課、計画課、建設課
会計管理局
- 管理部
- 総務課、公金管理課、会計企画課、出納課
- 警察・消防出納部
- 警察出納課、消防出納課
令和4年3月10日（東京都条例第1号、東京都組織条例の一部を改正する条例）
「生活文化局」を「生活文化スポーツ局」に改め、オリンピック・パラリンピック準備局を廃止する。
（4月1日から施行）
令和4年3月31日（東京都条例第49号、東京都立病院条例を廃止する条例）
東京都立病院条例を廃止する。
（7月1日から施行）
令和4年3月31日（東京都規則第57号、東京都組織規程の一部を改正する規則）
政策企画局総務部の「秘書課、管理課、渉外課」を「企画計理課、秘書課、管理課」に改める。
同局政策調整部を次のように改める。
- 「政策部
- 政策調整課、渉外課」
- 「戦略広報部
- 企画課、広報広聴課、報道課」
同局計画部を次のように改める。
同局戦略事業部を次に「オリンピック・パラリンピック調整部」を加え、その分課を次のように定める。
- 「オリンピック・パラリンピック調整部
- 管理課、調整課」
同局の次に「子供政策連携室」を加え、その分課を次のように定める。
総務局総務部の「グループ経営戦略課」の次に「情報公開課」を加える。
デジタルサービス局総務部「企画計理課」の次に「情報セキュリティ課」を加える。
同局戦略部「戦略課」の次に「区市町村ＤＸ支援課」を加える。
主税局課税部「査察課」を「調査査察課」に改める。
「生活文化局」を「生活文化スポーツ局」に改める。
生活文化局「広報広聴部」を廃止する。
同局都民生活部の次に「都民安全推進部」を加え、その分課を次のように定める。
- 「都民安全推進部
- 総合推進課、都民安全課、治安対策課、若年支援課」
同局文化振興部に次に「スポーツ総合推進部」及び「スポーツ施設部」を加え、その分課を次のように定める。
- 「スポーツ総合推進部
- 企画調整課、スポーツレガシー活用促進課、スポーツ課、国際大会課、パラスポーツ課」
- 「スポーツ施設部
- 調整課、施設整備第一課、施設整備第二課」
「オリンピック・パラリンピック準備局」を廃止する。
福祉保健局総務部「企画政策課、計理課、契約管財課」を「契約管財課」に改める。
同局総務部の次に「企画部」を加え、その分課を次のように定める。
（4月1日から施行）
福祉保健局感染症対策部の次に「都立病院支援部」を加え、その分課を次のように定める。
（7月1日から施行）
令和4年3月31日（東京都訓令第10号、東京都都民安全推進本部処務規程）
東京都都民安全推進本部処務規定を廃止する。
（4月1日から施行）
令和4年3月31日（東京都訓令第16号、東京都住宅政策本部処務規程）
住宅政策本部住宅企画部「企画経理課、民間住宅課、マンション課、不動産業課」を「企画経理課、技術管理課」に改める。
同部住宅企画部の次に「民間住宅部」を加え、その分課を次のように定める。
- 「民間住宅部
- 計画課、安心居住推進課、マンション課、不動産業課」
同部都営住宅経営部「施設整備課、技術管理課」を「再編利活用推進課、施設整備課」に改める。
（4月1日から施行）
令和4年3月31日（東京都訓令第17号、東京都病院経営本部処務規程）
東京都病院経営本部処務規定を廃止する。
（7月1日から施行）
政策企画局
- 総務部
- 総務課、企画計理課（R4.4.1）、秘書課、管理課
- 政策部（R4.4.1）
- 政策調整課（R4.4.1）、渉外課（R4.4.1）
- 戦略広報部（R4.4.1）
- 企画課（R4,4,1）、広報広聴課（R4.4.1）、報道課（R4.4.1）
- 計画調整部（R4.4.1）
- 計画調整課（R4.4.1）、プロジェクト推進課（R4.4.1）
- 外務部
- 管理課、企画課、事業課
- 戦略事業部
- 戦略事業課
- オリンピック・パラリンピック調整部（R4.4.1）
- 管理課（R4.4.1）、調整課（R4.4.1）
子供政策連携室（R4.4.1）
- 子供政策連携推進部（R4.4.1）
- 企画課（R4.4.1）、事業推進課（R4.4.1）
総務局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、文書課、法務課、グループ経営戦略課、情報公開課（R4.4.1）
- 復興支援対策部
- 被災地支援課、都内避難者支援課
- 人事部
- 人事課、職員支援課、制度企画課、調査課
- コンプライアンス推進部
- コンプライアンス推進課
- 行政部
- 振興企画課、区政課、市町村課
- 総合防災部
- 防災管理課、防災計画課、防災対策課、防災通信課
- 統計部
- 調整課、人口統計課、産業統計課、社会統計課
- 人権部
- 企画課、人権施策推進課
財務局
- 経理部
- 総務課、契約第一課、契約第二課、検収課
- 主計部
- 議案課、財政課、予算第一課、予算第二課、予算第三課、公債課
- 財産運用部
- 管理課、総合調整課、活用促進課
- 建築保全部
- 工務課、技術管理課、庁舎管理課、庁舎整備課、施設整備第一課、施設整備第二課、オリンピック・パラリンピック施設整備課
デジタルサービス局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、情報セキュリティ課（R4.4.1）
- 戦略部
- 戦略課、区市町村ＤＸ推進課（R4.4.1）、デジタル推進課、デジタル改革課
- デジタルサービス推進部
- デジタルサービス推進課、ネットワーク推進課
- デジタル基盤整備部
- 情報システム企画課、情報システム運用課
主税局
- 総務部
- 総務課、職員課、経理課
- 税制部
- 税制課、税制調査課、歳入課、システム管理課、評価審査課
- 課税部
- 計画課、課税指導課、法人課税指導課、調査査察課（R4.4.1）
- 資産税部
- 計画課、固定資産税課、固定資産評価課
- 徴収部
- 計画課、徴収指導課、納税推進課、個人都民税対策課、機動整理課
生活文化スポーツ局（R4.4.1）
- 総務部
- 総務課、企画計理課
- 都民生活部
- 管理法人課、地域活動推進課、男女平等参画課、旅券課
- 都民安全推進部（R4.4.1）
- 総合推進課（R4.4.1）、都民安全課（R4.4.1）、治安対策課（R4.4.1）、若年支援課（R4.4.1）
- 消費生活部
- 企画調整課、取引指導課、生活安全課
- 私学部
- 私学振興課、私学行政課
- 文化振興部
- 企画調整課、文化事業課
- スポーツ総合推進部（R4.4.1）
- 企画調整課（R4.4.1）、スポーツレガシー活用促進課（R4.4.1）、スポーツ課（R4.4.1）、国際大会課（R4.4.1）、パラスポーツ課（R4.4.1）
- スポーツ施設部（R4.4.1）
- 調整課（R4.4.1）、施設整備第一課（R4.4.1）、施設整備第二課（R4.4.1）
都市整備局
- 総務部
- 総務課、経理課、企画技術課
- 都市づくり政策部
- 広域調整課、都市計画課、土地利用計画課、開発企画課、緑地景観課
- 都市基盤部
- 調整課、交通企画課、街路計画課
- 市街地整備部
- 管理課、企画課、防災都市づくり課、区画整理課、再開発課、多摩ニュータウン課
- 市街地建築部
- 調整課、建築企画課、建築指導課、建設業課
- 基地対策部
-
住宅政策本部
- 住宅企画部
- 総務課、企画経理課、技術管理課（R4.4.1）
- 民間住宅部（R4.4.1）
- 計画課（R4.4.1）、安心居住推進課（R4.4.1）、マンション課（R4.4.1）、不動産業課（R4.4.1）
- 都営住宅経営部
- 経営企画課、指導管理課、資産活用課、住宅整備課、再編利活用推進課（R4.4.1）、施設整備課
環境局
- 総務部
- 総務課、環境政策課、経理課
- 地球環境エネルギー部
- 計画課、総量削減課、地域エネルギー課、環境都市づくり課、次世代エネルギー推進課
- 環境改善部
- 計画課、大気保全課、化学物質対策課、環境保安課、自動車環境課
- 自然環境部
- 計画課、緑環境課、水環境課
- 資源循環推進部
- 計画課、一般廃棄物対策課、産業廃棄物対策課
福祉保健局
- 総務部
- 総務課、契約管財課、職員課
- 企画部（R4.4.1）
- 企画政策課（R4.4.1）、計理課（R4.4.1）
- 指導監査部
- 指導調整課、指導第一課、指導第二課、指導第三課
- 医療政策部
- 医療政策課、救急災害医療課、医療安全課、医療人材課
- 保健政策部
- 保健政策課、健康推進課、疾病対策課、医療助成課、国民健康保険課
- 生活福祉部
- 計画課、保護課、地域福祉課
- 高齢社会対策部
- 計画課、介護保険課、在宅支援課、施設支援課
- 少子社会対策部
- 計画課、家庭支援課、育成支援課、保育支援課
- 障害者施策推進部
- 計画課、地域生活支援課、施設サービス支援課、精神保健医療課
- 健康安全部
- 健康安全課、食品監視課、薬務課、環境保健衛生課
- 感染症対策部
- 計画課、防疫・情報管理課、事業推進課
病院経営本部
- 経営企画部
- 総務課、財務課、職員課
- サービス推進部
- 事業支援課
産業労働局
- 総務部
- 総務課、企画調整課、計理課、職員課
- 商工部
- 調整課、創業支援課、経営支援課、地域産業振興課
- 金融部
- 金融課、貸金業対策課
- 観光部
- 企画課、振興課、受入環境課
- 農林水産部
- 調整課、食料安全課、農業振興課、水産課、森林課
- 雇用就業部
- 調整課、就業推進課、労働環境課、能力開発課
中央卸売市場
- 管理部
- 総務課、市場政策課、財務課
- 事業部
- 業務課、施設課
建設局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、技術管理課、職員課、用度課
- 用地部
- 管理課、用地課、調整課
- 道路管理部
- 管理課、路政課、監察指導課、保全課、安全施設課
- 道路建設部
- 管理課、計画課、鉄道関連事業課、街路課、道路橋梁課
- 三環状道路整備推進部
- 管理課、整備推進課
- 公園緑地部
- 管理課、計画課、公園課、公園建設課
- 河川部
- 管理課、指導調整課、計画課、改修課、防災課
港湾局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、財務課
- 港湾経営部
- 経営課、振興課
- 臨海開発部
- 開発企画課、誘致促進課、開発整備課、海上公園課
- 港湾整備部
- 建設調整課、計画課、技術管理課、施設建設課
- 離島港湾部
- 管理課、計画課、建設課
会計管理局
- 管理部
- 総務課、公金管理課、会計企画課、出納課
- 警察・消防出納部
- 警察出納課、消防出納課
令和4年6月30日（東京都規則第158号、東京都組織規程の一部を改正する規則）
環境局「地球環境エネルギー部」を「気候変動対策部」に、「次世代エネルギー推進課」を「家庭エネルギー対策課」に改める。
産業労働局金融部の次に「産業・エネルギー政策部」を加え、その分課を次のように定める。
- 「産業・エネルギー政策部
- 計画課、事業者エネルギー推進課、新エネルギー推進課」
（7月1日から施行）
政策企画局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、秘書課、管理課
- 政策部
- 政策調整課、渉外課
- 戦略広報部
- 企画課、広報広聴課、報道課
- 計画調整部
- 計画調整課、プロジェクト推進課
- 外務部
- 管理課、企画課、事業課
- 戦略事業部
- 戦略事業課
- オリンピック・パラリンピック調整部
- 管理課、調整課
子供政策連携室
- 子供政策連携推進部
- 企画課、事業推進課
総務局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、文書課、法務課、グループ経営戦略課、情報公開課
- 復興支援対策部
- 被災地支援課、都内避難者支援課
- 人事部
- 人事課、職員支援課、制度企画課、調査課
- コンプライアンス推進部
- コンプライアンス推進課
- 行政部
- 振興企画課、区政課、市町村課
- 総合防災部
- 防災管理課、防災計画課、防災対策課、防災通信課
- 統計部
- 調整課、人口統計課、産業統計課、社会統計課
- 人権部
- 企画課、人権施策推進課
財務局
- 経理部
- 総務課、契約第一課、契約第二課、検収課
- 主計部
- 議案課、財政課、予算第一課、予算第二課、予算第三課、公債課
- 財産運用部
- 管理課、総合調整課、活用促進課
- 建築保全部
- 工務課、技術管理課、庁舎管理課、庁舎整備課、施設整備第一課、施設整備第二課、オリンピック・パラリンピック施設整備課
デジタルサービス局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、情報セキュリティ課
- 戦略部
- 戦略課、区市町村ＤＸ推進課、デジタル推進課、デジタル改革課
- デジタルサービス推進部
- デジタルサービス推進課、ネットワーク推進課
- デジタル基盤整備部
- 情報システム企画課、情報システム運用課
主税局
- 総務部
- 総務課、職員課、経理課
- 税制部
- 税制課、税制調査課、歳入課、システム管理課、評価審査課
- 課税部
- 計画課、課税指導課、法人課税指導課、調査査察課
- 資産税部
- 計画課、固定資産税課、固定資産評価課
- 徴収部
- 計画課、徴収指導課、納税推進課、個人都民税対策課、機動整理課
生活文化スポーツ局
- 総務部
- 総務課、企画計理課
- 都民生活部
- 管理法人課、地域活動推進課、男女平等参画課、旅券課
- 都民安全推進部
- 総合推進課、都民安全課、治安対策課、若年支援課
- 消費生活部
- 企画調整課、取引指導課、生活安全課
- 私学部
- 私学振興課、私学行政課
- 文化振興部
- 企画調整課、文化事業課
- スポーツ総合推進部
- 企画調整課、スポーツレガシー活用促進課、スポーツ課、国際大会課、パラスポーツ課
- スポーツ施設部
- 調整課、施設整備第一課、施設整備第二課
都市整備局
- 総務部
- 総務課、経理課、企画技術課
- 都市づくり政策部
- 広域調整課、都市計画課、土地利用計画課、開発企画課、緑地景観課
- 都市基盤部
- 調整課、交通企画課、街路計画課
- 市街地整備部
- 管理課、企画課、防災都市づくり課、区画整理課、再開発課、多摩ニュータウン課
- 市街地建築部
- 調整課、建築企画課、建築指導課、建設業課
- 基地対策部
-
住宅政策本部
- 住宅企画部
- 総務課、企画経理課、技術管理課
- 民間住宅部
- 計画課、安心居住推進課、マンション課、不動産業課
- 都営住宅経営部
- 経営企画課、指導管理課、資産活用課、住宅整備課、再編利活用推進課、施設整備課
環境局
- 総務部
- 総務課、環境政策課、経理課
- 気候変動対策部（R4.7.1）
- 計画課、総量削減課、地域エネルギー課、環境都市づくり課、家庭エネルギー対策課（R4.7.1）
- 環境改善部
- 計画課、大気保全課、化学物質対策課、環境保安課、自動車環境課
- 自然環境部
- 計画課、緑環境課、水環境課
- 資源循環推進部
- 計画課、一般廃棄物対策課、産業廃棄物対策課
福祉保健局
- 総務部
- 総務課、契約管財課、職員課
- 企画部
- 企画政策課、計理課
- 指導監査部
- 指導調整課、指導第一課、指導第二課、指導第三課
- 医療政策部
- 医療政策課、救急災害医療課、医療安全課、医療人材課
- 保健政策部
- 保健政策課、健康推進課、疾病対策課、医療助成課、国民健康保険課
- 生活福祉部
- 計画課、保護課、地域福祉課
- 高齢社会対策部
- 計画課、介護保険課、在宅支援課、施設支援課
- 少子社会対策部
- 計画課、家庭支援課、育成支援課、保育支援課
- 障害者施策推進部
- 計画課、地域生活支援課、施設サービス支援課、精神保健医療課
- 健康安全部
- 健康安全課、食品監視課、薬務課、環境保健衛生課
- 感染症対策部
- 計画課、防疫・情報管理課、事業推進課
- 都立病院支援部（R4.7.1）
- 法人調整課（R4.7.1）
産業労働局
- 総務部
- 総務課、企画調整課、計理課、職員課
- 商工部
- 調整課、創業支援課、経営支援課、地域産業振興課
- 金融部
- 金融課、貸金業対策課
- 産業・エネルギー政策部（R4.7.1）
- 計画課（R4.7.1）、事業者エネルギー推進課（R4.7.1）、新エネルギー推進課（R4.7.1）
- 観光部
- 企画課、振興課、受入環境課
- 農林水産部
- 調整課、食料安全課、農業振興課、水産課、森林課
- 雇用就業部
- 調整課、就業推進課、労働環境課、能力開発課
中央卸売市場
- 管理部
- 総務課、市場政策課、財務課
- 事業部
- 業務課、施設課
建設局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、技術管理課、職員課、用度課
- 用地部
- 管理課、用地課、調整課
- 道路管理部
- 管理課、路政課、監察指導課、保全課、安全施設課
- 道路建設部
- 管理課、計画課、鉄道関連事業課、街路課、道路橋梁課
- 三環状道路整備推進部
- 管理課、整備推進課
- 公園緑地部
- 管理課、計画課、公園課、公園建設課
- 河川部
- 管理課、指導調整課、計画課、改修課、防災課
港湾局
- 総務部
- 総務課、企画計理課、財務課
- 港湾経営部
- 経営課、振興課
- 臨海開発部
- 開発企画課、誘致促進課、開発整備課、海上公園課
- 港湾整備部
- 建設調整課、計画課、技術管理課、施設建設課
- 離島港湾部
- 管理課、計画課、建設課
会計管理局
- 管理部
- 総務課、公金管理課、会計企画課、出納課
- 警察・消防出納部
- 警察出納課、消防出納課